1、一是矮化砧木的矮化性越强,树势越弱,寿命越短。尤其在土壤瘠薄和干旱地区表现更为明显。因此我们建议大水大肥,土壤肥沃地区选择种植。
2、二是由于矮化砧木根系浅,抗倒伏能力差,中央干不好培养,且对风等自然灾害抵抗力弱,需要设立支柱。
3、三是矮化砧木育苗繁殖比乔化砧较困难,繁殖中间砧苗木,需要2次嫁接,繁殖自根砧苗木,生根比较困难。这也是矮化苗木价格高于乔化苗木的原因。
4、四是矮化密植栽培建园成本较高,一般矮化苹果苗价较高,栽植密度大,在许多地区,还需要设立支柱,防止倒伏。然而,矮化砧木这些缺点大都是可以通过加强管理和运用科技成果加以克服的。如矮砧根系浅,固地性和适应性差的问题,可采取矮化中间砧嫁接和选育适应性强的矮砧等办法来解决。