蕨类植物的病虫害相对较少，但大多数蕨类植物喜欢生长在高温高湿的环境条件下，病虫危害也不可避免。在栽培管理过程中也要加以防治，以提高观赏效果。
一、侵染性病害
由病菌造成，使蕨类出现各种病斑，影响观赏。危害严重者还会导致死亡。主要有炭疽病、褐斑病、线虫病、锈病、煤污病、猝倒病等。
1. 炭疽病。真菌病害，其特征是病斑处有粉红色黏状物，主要危害植株的嫩叶。被害部位开始在叶缘或叶尖呈水渍状圆形、近圆形的暗褐色小斑，而后逐渐由几个病斑扩大成不规则的斑块，颜色变为焦黄，有的病斑成云片状，边缘有浅红色晕圈，后期病斑中部变为灰白色，有许多微小黑点，严重时整个叶片死亡。波斯顿蕨柔软的生长点受这种病菌的侵害，顶端变成褐色，萎蔫，损害植物的商品外观。病菌以菌丝体、分生孢子或子囊腔在病叶上过冬，当温度升到20℃、相对湿度超过75%时开始发病，病菌借雨水传播，在25℃、湿度为80%~90%时蔓延迅速。
防治：此病以预防为主，在新叶形成的梅雨季节和高温高湿季节应喷药预防。调节温室的温、湿度和通风条件，保持叶片干燥，杜绝病株引入，彻底清除附近的病残体，可预防此病的发生。在发病前或发病初期，每隔7天喷药1次，连喷2~3次，能收到良好效果。有效的药剂有75%百菌清500倍液、50%多菌灵可湿性粉剂800~1000倍液或70%托布津可湿性粉剂800~1000倍液，大生、利得可、施保克等杀菌剂也有很好的防治效果。
2. 褐斑病。蕨类植物的褐斑病又叫叶斑病或叶枯病，常发生在叶片的顶端，受害叶片初期为圆形黑斑，后扩大成圆形或近圆形，病斑边缘黑褐色，中央灰黑色并有小黑点，此后病斑扩大迅速，叶片最后变成黑色干枯死亡。其主要传播途径是落叶，春夏秋季均有可能发生，高温多湿季节易流行。
防治：发现病株要立即隔离喷药，或剪除并集中焚烧，同时喷药保护。可采用50%多菌灵1000倍液、50%甲基托布津1000倍液、200倍波尔多液等药剂喷施防治。浇水过多或湿度过大，也易发生褐斑病。发病初期，可用50%代森铵水溶液300~400倍液、70%托布津可湿性粉剂800~1000倍液等药剂喷施防治。
3. 线虫病。又称根瘤线虫或根结线虫，病原物为白色线状两头尖的软体虫子。病株发生褐斑萎蔫，并逐渐枯死。多种温室蕨类植物受线虫的侵害，可由带红褐色或带黑色、从中肋延伸到叶沿的带线辨认出来。把一小片褐色斑块放入水中，显微镜下观察，可清楚地看到小蠕虫在四处活动。
防治：清除受害叶片，消除其生长条件，有利于减轻线虫的侵害。用10%克线磷、克线丹或25%丙线磷等杀虫剂，施药后覆盖新鲜黄土，灌少量水，可显著压低根结线虫虫口密度。也有用热水处理防治巢蕨的线虫侵害的，栽植前用43℃热水浸泡植株10~15分钟。
4. 锈病。锈病可发生在蕨类植物的翠云草等种类上，它每年3~4月在幼嫩叶基部反面叶脉上产生担孢子，侵入植株而产生性孢子器与锈孢子器。5月份叶面上散发淡黄色粉末状夏孢子，然后产生褐色的冬孢子，如果大量孢子器侵入植株，植株就会生长不良。
防治：可用65%代森锌可湿性粉剂500倍液、1:1:50波尔多液等进行防治，每隔10~15天喷1次，连喷3~4次，可取得一定效果。
5. 煤污病。蕨类植物的叶片被黑色霉菌的孢子和菌丝体覆盖，通常生长在介壳虫及其它刺吸式昆虫所分泌的蜜露上。应反复喷洒烟碱及肥皂，以防治介壳虫及其它刺式昆虫。
6. 猝倒病。此种病害由两三种不同的真菌引起，使原叶体变软、发黑而解体，在播种养殖蕨类植物时经常发生。应将蕨类植物孢子播种在用蒸汽消毒处理过的土壤上，或用地可松溶液浇灌处理土壤，也有助于抗御猝倒病。
二、生理性病害
1. 日灼病。多数蕨类喜温暖半阴，不耐强光，光强度以1000~6000Lx为宜。强烈光直射会使叶片干缩脱水，枯黄或焦边。防治方法：在半阴状态下，辅以2~3小时的阳光，可保持蕨叶常绿；已经焦边的蕨叶，除及时剪去保持叶片整齐外，应悉心养护，避免受到强烈光线的刺激。
2. 湿度失调。空气过于干燥，易造成叶片卷边，故春夏生长盛期需多浇水。但夏季蕨类栽培土既要保持湿润，又不能太湿，以免造成根系生长不良；秋末应控制浇水，保持稍湿润即可；越冬休眠期应减少喷水，以免烂叶。
3. 温度不适。①高温危害。大部分蕨类植物要求适温为18~25℃。盛夏短时的高温也会使蕨叶萎蔫、灼焦。因此，从4月下旬开始，要通过覆盖遮阳、地面洒水及通风措施来降低温度。②低温危害。铁线蕨等半耐寒蕨类要求气温不能低于5℃，下延三叉蕨、鸟巢蕨、瘤蕨等不耐寒蕨类则不能低于10℃。温度太低，叶片受伤害，引起萎蔫、变黑，甚至植株死亡。可采取覆盖、熏烟、多施暖性肥料等措施，保证安全越冬。
4. 营养不良。①缺素症。土壤中缺乏氮、钾、钙、镁、硫等元素，易造成蕨类生长发育异常。铁线蕨、银粉背蕨、矩圆石韦等喜钙蕨类，可在栽培土中掺入少量石灰、骨粉或碎蛋（贝）壳等。紫萁、狗脊蕨、鸟巢蕨、乌蕨等喜酸蕨类，应定期喷施0.1%~0.2%硫酸亚铁溶液或结合施肥浇矾肥水。②过剩症。主要指氮、磷、锰、硼等元素过剩。肥害严重时，可用冲水施救，具体做法是，将土疏松，用长流自来水进行半天冲洗，一般冲洗1~2次即可见效。生产上应注意施肥次数和肥料浓度，尽量使用肥效持久的农家肥，如厩肥、骨粉、饼肥、草木灰等，以保持蕨类旺盛生长。
三、常见虫害
蕨类植物的主要虫害有介壳虫、蚜虫、红蜘蛛、蛞蝓等。
1. 介壳虫。在多种介壳虫中，褐软蚧和夹桃蚧危害最为严重，其它蚧类较少见。介壳虫寄生于蕨类植物叶片边缘或叶背面，其幼虫期很短，行动缓慢，当移动到叶背时，即开始结壳，用刺吸式口器吮吸植物体内的汁液。介壳虫养殖速度较快，虫量较多时会抑制植物的生长并引起植株枯萎，严重时整株植株会枯黄死亡，同时诱发煤污病。被害叶片出现斑点，影响生长及观赏。雌成虫可连续生出幼介壳虫，幼虫两个月就可以长成成虫，初孵低龄若虫抗药性较差，此时是化学防治的关键时期。没有特效药防治，一般以预防为主。应注意检查，保持环境通风。在种植蕨类时，要控制叶面不要过湿，并经常检查叶片正反两面，虫害少量发生时可采取人工刷除；5月下旬为介壳虫孵化盛期，此时可用40%氧化乐果乳剂、50%马拉硫磷、25%亚胺硫磷、80%敌敌畏乳剂1000倍液喷雾防治。马拉硫磷喷洒剂对爬行阶段的介壳虫极有效。反复喷洒烟碱及肥皂也能清除介壳虫侵害。虫害严重时，要将整片叶子剪掉并焚烧。少数蕨类对有机磷有过敏反应，施用前应先试验。还应注意和利用红霉菌等蚧类天敌。
2. 蚜虫。蚜虫常见的有黑色和绿色两种，通常出现在早春和夏初，常群居于蕨类植物幼嫩茎梢处。为害时用刺吸式口器吮吸植物体内的汁液，使植物生长停滞，叶片变黄。另外，蚜虫的分泌物常招致各种霉菌的寄生，易产生煤污病。防治时，可先用肥皂水清洗，再喷施40%乐果或氧化乐果1000~1500倍液、杀灭菊酯2000~3000倍液、2.5%鱼藤精1000~1500倍液、敌百虫1000倍液等防治。
3. 红蜘蛛。红蜘蛛为螨类，体积小，养殖速度快，1年可养殖10代左右。红蜘蛛用刺吸式口器吮吸蕨类植物的汁液，使植物生长停滞，叶片发黄。由于体形小，养殖快，肉眼又较难发现，若防治不及时，危害会很严重。高温持续季节采用三氯杀螨醇800~1000倍液、50%氧化乐果1000倍液交替防治。
4. 蛞蝓。蛞蝓又称鼻涕虫，属腹足纲，蛞蝓科，形状似去壳的蜗牛。壳通常退化，外套膜被覆全背部。触角两对，第二对顶端生眼。肺孔开于体前右侧，身体能分泌粘液，爬行后留下银白色条痕。初夏在树皮下及石下产白色的卵。蛞蝓是危害蕨类植物的主要害虫之一，它常藏匿在盆钵的内壁、底部漏水孔处，或植株的基部及土壤表面的覆盖物下，喜夜间出来活动，咬食蕨类植物的幼嫩枝叶。可在夜间22~23时喷施70~100倍的氨水进行防治，并可达到施肥的目的。也可采用人工捕捉。蛞蝓再生能力强，捕到的蛞蝓要丢到盐酸溶液中杀死。在温暖潮湿环境中，除蛞蝓外，还有蜗牛、鼠妇等小动物大量滋生，狂食蕨叶；蚯蚓则吞食蕨类幼根，使其生长停滞。可撒施灭蜗灵、蜗牛敌粉剂、密达杀螺或石灰，也可喷洒氨水、高浓度食盐水、硫酸铜等防治，还可实施人工捕杀。
四、藓类和地衣的危害
这些植物不会直接危害蕨类，但能对蕨类植物原叶体和小植株造成遮阳和影响。它们扩散速度快，能很快铺满地面，阻止水分和养分进入土壤，影响蕨类植物生长。处理办法：在播种孢子前用蒸馏水对土壤进行消毒处理，以免土壤被其它孢子植株污染。另外，不干净的浇水用具也是污染源之一。提供适宜的温度和肥料，使蕨类植物的原叶体快速生长并成熟，以减少其它孢子植物的影响，是较好地避免危害的方法。
